棉花種子脫絨方式分為機械脫絨和化學脫絨兩大類。
機械脫絨方式：目前使用的“刷輪式棉種脫絨成機”，該機采用純機械方式脫去短絨。其特點是：操作簡單、維修方便，加工成本低，生產過程只需電力，不需要其它附屬設施和輔料，但破損率偏高。
化學脫絨方式：目前普通應用的有泡沫酸脫絨和稀硫酸（過量）脫絨兩種工藝。稀硫酸（過量）脫絨與泡沫酸脫絨的主要區別是：過量式酸脫絨用硫酸量超過實際用量的3～4倍和棉種攪拌，然后將多余的酸液甩掉回收過濾再用。而泡沫酸脫絨是將脫絨用量稀硫酸液加上一定量的發泡劑，使硫酸液體積增大30～50倍，以泡沫的形式覆蓋棉籽表面，棉籽靠毛細管的作用吸收酸液附在短絨上，所以對有刀傷和裂紋的棉種發芽影響不大，因為不是浸泡。
機械脫絨方式：目前使用的“刷輪式棉種脫絨成機”，該機采用純機械方式脫去短絨。其特點是：操作簡單、維修方便，加工成本低，生產過程只需電力，不需要其它附屬設施和輔料，但破損率偏高。
化學脫絨方式：目前普通應用的有泡沫酸脫絨和稀硫酸（過量）脫絨兩種工藝。稀硫酸（過量）脫絨與泡沫酸脫絨的主要區別是：過量式酸脫絨用硫酸量超過實際用量的3～4倍和棉種攪拌，然后將多余的酸液甩掉回收過濾再用。而泡沫酸脫絨是將脫絨用量稀硫酸液加上一定量的發泡劑，使硫酸液體積增大30～50倍，以泡沫的形式覆蓋棉籽表面，棉籽靠毛細管的作用吸收酸液附在短絨上，所以對有刀傷和裂紋的棉種發芽影響不大，因為不是浸泡。
