水稻抽穗期遇連續低溫陰雨天氣，應普遍用藥防治稻瘟病，對易感病品種，應在破口期（全田水稻破口10%－15%）和齊穗期（全田水稻80%穗子抽出），兩次用藥防治。適用藥劑有稻瘟靈、三環唑、咪鮮胺等。其中稻瘟靈、三環唑等藥有極強的內吸傳導性，一般施藥后有2－3小時不下雨，防效就能得到保證。從天氣預報看，近期各地多為雷陣雨天氣，可以根據情況，趁雨隙噴藥。雨后稻葉上有水時，宜適當減少用水量，細噴霧或者用彌霧機噴藥。這樣，高濃度的藥液落到有水的稻葉上，能二次稀釋，均勻分布到葉面，避免大量藥液從葉面滑落，影響防效。
防治稻曲病，一般應在水稻破口前1周左右施藥。據江蘇省農科院等單位多年前的試驗研究，用井岡霉素防治稻曲病，在水稻破口前1周左右施藥效果最好，到破口期再施藥，幾乎沒有防治效果。從近幾年試驗示范和大面積生產用藥情況看，適用于防治稻曲病的苯甲？丙環唑、戊唑醇等唑類殺菌劑，銅高尚堿式硫酸銅、琥膠肥酸銅等銅制劑以及咪鮮胺等藥劑，在水稻抽穗期使用，對稻曲病也有一定的防效。水稻破口前1周沒有用藥防治稻曲病的田塊，可以考慮在抽穗期因地制宜地選用上述藥劑防治稻曲病。
唑類殺菌劑在水稻抽穗期過量使用，特別是在遇低溫陰雨水稻生長受抑制的情況下過量施藥，可能影響水稻抽穗和灌漿結實，施藥時應嚴格掌握用量，不盲目增加用量。咪鮮胺以及銅高尚堿式硫酸銅等藥，對稻曲病和稻瘟病均有較好防效，正常使用對水稻的藥害風險小，水稻抽穗期可以優先使用這些藥劑，或者將其與其他藥劑混用或交替使用。
