臨床癥狀及剖檢病變自然感染潛伏期3天～5天，大流行期間病毒數量多可以縮短到15小時～30小時。經典毒株造成的發病表現為腹瀉、水樣腹瀉、黃色或灰色、嘔吐，小豬可能出現脫水。成年豬通常只表現厭食、嘔吐、沉郁等。剖檢病死豬主要病變發生在小腸里，小腸膨脹，充滿黃色液體，腸壁變薄，個別豬小腸黏膜出血，腸系膜淋巴結水腫，其他器官無明顯病變，變異毒株主要造成新生仔豬發病，病變特點同上。
對于新生仔豬腹瀉大流行的分析母豬初乳中免疫球蛋白主要為IgG，不含或很少有IgA，IgA濃度伴隨IgG數量減少而增大，仔豬出生36小時后開始在腸道表面積累IgA，到第四天才會積累較多的IgA，形成對腸道黏膜的保護。也就是說其實出生3天內仔豬可以抵抗全身感染，但是腸道黏膜保護力幾乎為0，難以抵抗腸道病原對于腸道黏膜的侵襲。流行性腹瀉病毒的自然潛伏期為5天，變異后病毒毒力增強，在大流行時豬場有很多病毒，仔豬一出生就被感染大量病毒，潛伏期縮短，3天時就大量繁殖，搶先一步占據大部分腸道細胞，進而豬出現劇烈腹瀉進而脫水死亡。
病原特點造成豬發病的病原為RNA病毒中的一種冠狀病毒（PEDV），具有囊膜和纖突，容易被多種消毒劑滅活。經典毒株對各種年齡的豬都易感，最新的變異毒株主要對新生仔豬易感，其他豬不容易發生。病毒經口鼻進入小腸，在小腸絨毛上皮細胞內增殖，進而造成細胞損傷，豬只出現嚴重腹瀉。該病毒多經發病豬的糞便排出，運輸車輛、發病豬舍員工的鞋子都可以成為傳播媒介。該病可以與大腸桿菌等混合感染，進而造成更為嚴重的腹瀉。
治療
1.仔豬發病后立即注射抗病毒藥物。
2.提前制備流行性腹瀉的卵黃抗體，發病時立即給每頭仔豬灌服。
3.對于脫水的豬進行腹腔補液。
預防
當前形勢下主要應加強對于新生仔豬的預防工作，原則只有一個，想方設法增加新生仔豬的腸道保護力，降低感染及繼發感染的壓力。
1.產前30天左右免疫2次腹瀉滅活苗，母豬產前20天開始在飼料中添加奧來可（1公斤拌料1噸），增加母豬奶水質量特別是抗體總量。
2.仔豬出生后盡快吃初乳，增加自身抗體含量。
3.對于已發病豬場將母豬分娩改在配種舍，減少定植在仔豬體內的病毒數量，在仔豬滿4日齡時再將仔豬轉入哺乳母豬舍，同時要每天及時清除病豬糞便與消毒，減少病毒數量。
