我國雖然每年糧食都在不斷的增產(chǎn)，但是我國糧食在增產(chǎn)的同時我國的農(nóng)業(yè)環(huán)境卻付出了巨大的代價，近期，環(huán)境保護部和國土資源部聯(lián)合發(fā)布了2005-2013年全國土壤污染狀況調(diào)查公報。結(jié)果顯示，在實際調(diào)查面積630萬平方公里中，全國土壤環(huán)境狀況總體不容樂觀，部分地區(qū)土壤污染較重，全國土壤總超標(biāo)率16.1%，土壤污染已成為我國許多地方的“公害”。

　　在土壤污染嚴(yán)重的形勢下，相關(guān)土肥專家建議，可以通過農(nóng)藝手段如增加土壤有機質(zhì)、施用土壤調(diào)理劑、采用生物吸收法等能夠鈍化、減輕甚至修復(fù)大多數(shù)的超標(biāo)土壤。特別是向土壤中施入微生物肥料將是土壤生態(tài)修復(fù)的重要發(fā)展方向。

　　土壤污染主要可以分為無機污染物和有機污染物，無機污染物主要包括酸、堿、重金屬、鹽類等；有機污染物主要包括有機農(nóng)藥、酚類、氰化物、石油、合成洗滌劑等。微生物肥料修復(fù)土壤的基本原理是在適當(dāng)?shù)臈l件（水分、溫度、pH值等）下，肥料中的微生物菌群與土壤中原有的有益微生物共同形成優(yōu)勢菌群，促進土壤生態(tài)系統(tǒng)中碳、氮、氧等元素的良性循環(huán)，從而修復(fù)土壤生態(tài)環(huán)境系統(tǒng)，使生態(tài)系統(tǒng)達到新的穩(wěn)定的平衡。

　　其中，微生物肥料對無機污染物的修復(fù)機理是微生物肥料進入土壤生態(tài)系統(tǒng)后，好氧菌、厭氧菌等微生物益生菌群，通過自身的生物反應(yīng)，降低土壤的酸度，提高土壤的pH值，從而降低土壤中有害重金屬的毒害；同時肥料中的微生物菌可以將重金屬固定，促使土壤中活性重金屬變?yōu)橛袡C結(jié)合態(tài)，形成過濾層和隔離層，降低作物對土壤中重金屬的吸收，從而避免了土壤中重金屬等有害物質(zhì)或其分解產(chǎn)物通過“土壤植物人體”，或通過“土壤水人體”間接被人體吸收，損害身體健康。

　　微生物肥料在對土壤中農(nóng)藥等有機污染物修復(fù)方面的作用是降低病蟲害的防治次數(shù)，降低農(nóng)藥的使用量，從而減少農(nóng)藥在作物中的殘留量。其一，微生物肥料能改變土壤耕作層微生物區(qū)系，在作物根系周圍形成優(yōu)勢菌落，從而強烈抑制病原菌繁殖，降低病蟲害發(fā)生次數(shù)；另一方面，微生物在其生命活動過程中產(chǎn)生多種物質(zhì)，如激素類、腐植酸類以及抗生素類，這些物質(zhì)能刺激作物生長健壯，增強作物自身抗病害能力。