含有害離子肥料：氯化鉀、氯化銨等化肥含有氯離子，施于土壤后，會產生水溶性的氯化物，對種子發芽和幼苗生長不利。硝酸銨和硝酸鉀含有硝酸根離子，對種子發芽影響很大，不宜作種肥。
含有毒害作用的肥料：尿素在生產過程中，常生成少量的縮二脲，該物質含水量超過2％，對種子和幼苗就會產生毒害。另外，含氮量高的尿素分子也會滲透到種子的蛋白質分子結構中，使蛋白質變性，影響種子發芽。
含有腐蝕作用的肥料：碳酸氫銨具有腐蝕性和揮發性 ，對種子有強烈的腐蝕作用。用這類肥料作中藥栽培種肥對種子發芽和幼苗生長要會產生嚴重危害。如一定需施用，可將上類肥料施在溝下或底層，上面覆蓋土層才能撒播藥種；也可將過磷酸鈣與土雜肥混合施用。
只要藥農認真科學使用化肥，在拌種和幼苗移栽時避免以上三類有刺激的肥料，可以減少有害化肥對種子和幼苗的毒害，減少燒種芽、燒苗現象的發生，進而提高中藥材的質量和產量，來年實現豐收。
