棘頭蟲以吻突和角質小鉤牢牢地叮在腸黏膜上，可嚴重損傷腸黏膜，發生壞死和潰瘍，如損傷達到漿膜層，可引起灰色或淡黃色的化膿病灶（結節），透過漿膜可看到。在炎癥部位組織學切片可觀察到吻突周圍有嗜酸性細胞帶。有的在發炎區可發現大量細菌。如果吻突鉆得過深，可發生腸穿孔，誘發腹膜炎而死亡。