急性豬滑液支原體感染的關節，滑膜腫脹、水腫和充血。滑液量明顯增加，呈黃褐色，可能含有纖維素片。亞急性感染的病豬，滑膜黃色到褐色，充血，增厚。絨毛可能輕度肥大。慢性期間，滑膜增厚更為明顯，可能見到血管翳形成。有時能見到關節軟骨出現病變。但是，Roberts等(1972)記載了兩頭病豬膝關節關節軟骨潰爛。關節炎是唯一一致的病變。

在急性期的顯微病變與豬鼻支原體關節炎時見到的非常類似。絨毛輕度肥大，滑膜細胞層加厚，滑膜下組織被淋巴細胞、漿細胞及巨噬細胞浸潤。