鴨霍亂主要為敗血性病理變化，肉眼可見的表現為漿膜和黏膜上有小點出血。肝臟表面有針頭大小、灰白色、邊緣整齊的壞死點；脾臟腫大、表面有大小不等的壞死點；心冠溝、心內膜、心外膜出血和心包積液；肺充血和出血；十二指腸和直腸黏膜出血，腹腔內、胃和腸系膜脂肪表面出血。
1.最急性型
最急性型死亡快，剖檢無明顯病理變化。
2.急性型
急性病例以敗血癥為主要變化。十二指腸的出血最為嚴重，發生嚴重的急性卡他性腸炎或出血性腸炎，腸內容物中含有血液；肝臟腫大，色澤變淡，質地稍硬，表面散布針尖大小的黃色或灰白色壞死點；脾臟稍腫大，質柔軟；心外膜下或漿膜下常見點狀或片狀出血，心包積液，偶爾混有纖維素性凝塊；肺充血，表面有出血點，有時有肺炎；產蛋母鴨的卵巢常呈成熟卵泡疏松外觀，表面血管模糊不清。
3.慢性型
慢性型的病變因病菌入侵的器官而異。有的表現鼻腔和上呼吸道內積液，有的在關節和腱鞘內蓄積混濁或干酪樣的滲出物。母鴨的卵巢常發生明顯變化，卵子形狀不整齊，質地柔軟，有時可見到一種淡綠色的卵子，卵巢周圍有一種堅實、黃色的干酪樣物質，有時粘在內臟器官的表面；肝臟稍腫，呈土黃色，質地脆弱，表面密布針尖大小的灰黃色壞死點，膽囊腫大，充滿綠色油狀液體；眼角膜下有出血小點和淺表潰瘍；心外膜有出血點，心包積液明顯，呈淡黃色、透明，內混有纖維素。
1.最急性型
最急性型死亡快，剖檢無明顯病理變化。
2.急性型
急性病例以敗血癥為主要變化。十二指腸的出血最為嚴重，發生嚴重的急性卡他性腸炎或出血性腸炎，腸內容物中含有血液；肝臟腫大，色澤變淡，質地稍硬，表面散布針尖大小的黃色或灰白色壞死點；脾臟稍腫大，質柔軟；心外膜下或漿膜下常見點狀或片狀出血，心包積液，偶爾混有纖維素性凝塊；肺充血，表面有出血點，有時有肺炎；產蛋母鴨的卵巢常呈成熟卵泡疏松外觀，表面血管模糊不清。
3.慢性型
慢性型的病變因病菌入侵的器官而異。有的表現鼻腔和上呼吸道內積液，有的在關節和腱鞘內蓄積混濁或干酪樣的滲出物。母鴨的卵巢常發生明顯變化，卵子形狀不整齊，質地柔軟，有時可見到一種淡綠色的卵子，卵巢周圍有一種堅實、黃色的干酪樣物質，有時粘在內臟器官的表面；肝臟稍腫，呈土黃色，質地脆弱，表面密布針尖大小的灰黃色壞死點，膽囊腫大，充滿綠色油狀液體；眼角膜下有出血小點和淺表潰瘍；心外膜有出血點，心包積液明顯，呈淡黃色、透明，內混有纖維素。
